O Museu Municipal de Arqueologia apresenta um discurso museográfico relacionado com o desenrolar do processo histórico, no concelho de Albufeira e nos concelhos limítrofes, desde a Pré-História, terminando nos séculos XVI e XVII, através de cinco grandes núcleos temáticos: Pré-História, Período Romano, Período Visigótico e Islâmico, e Idade Moderna. O seu acervo é formado pela coleção da Paróquia de Albufeira, reunida pelo Pe. Semedo de Azevedo na década de 60 do século XX (património arqueológico e um conjunto de elementos arquitetónicos e artefactos da Villa Romana da Retorta e da antiga Igreja Matriz de Albufeira), espólios encontrados durante prospeções arqueológicas realizadas no concelho, assim como por testemunhos provenientes de coleções públicas e privadas, através da assinatura de protocolos, ofertas ou simples depósitos.